L'estudi revela el model d'obertura i tancament de la proteïna portal durant el procés de maduració de la càpsida viral, on el virus incorpora el seu material genètic. Els investigadors han emprat una combinació de tècniques de criomicroscòpia i cristal·lografia per estudiar aquests virus que infecten bacteris.
Un estudi amb participació del Consell Superior d'Investigacions Científiques (CSIC) i l'Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona) ha desxifrat l'estructura i el mecanisme d'actuació d'un complex clau en la infecció del virus bacteriòfag T7. Els resultats es publiquen a la revista Nature Communications.
El treball és fruit de la col·laboració d'experts en criomicroscopía electrònica del Centre Nacional de Biotecnologia (CSIC), dirigits per José L. Carrascosa, i en cristal·lografia de raigs X de l'Institut de Biologia Molecular de Barcelona (IBMB-CSIC) i l'Institut de Recerca Biomèdica (IRB Barcelona), dirigits per Miquel Coll. Els diferents grups d'investigació han treballat de manera conjunta per combinar els resultats de les dues tècniques, obtenint noves dades sobre el mecanisme d'actuació d'aquesta proteïna en el procés de maduració viral.
"Els bacteriòfags són virus que infecten bacteris. A més del seu interès com a model d'estudi per la seva simplicitat genètica però gran complexitat estructural, ara mateix són un nou focus d'atenció per als investigadors donat el seu potencial com a alternativa a l'ús d'antibiòtics", explica José L. Carrascosa, investigador del Centre Nacional de Biotecnologia i codirector del treball.
Durant el cicle de l'bacteriòfag T7 es forma una càpsida viral on el virus necessita incloure el seu material genètic, introduint a través d'un petit canal d'entrada format per la proteïna portal que posteriorment es tanca amb la proteïna de la cua del virus. Fins ara es desconeixia quin era el mecanisme que permetia obrir i tancar aquesta "porta" d'entrada de manera controlada.
"Aquests virus bacterians tenen un mecanisme per empaquetar el seu ADN similar als dels virus herpes que infecten humans. Per això, desxifrar com funcionen ajuda a entendre com actuen virus patògens que ens afecten", indica Miquel Coll, investigador de l'Institut de Biologia Molecular de Barcelona i de l'IRB Barcelona i codirector de l'estudi.
Ana Cuervo, investigadora del Centre Nacional de Biotecnologia, i Montserrat Fàbrega-Ferrer, de l'IRB Barcelona i de l'Institut de Biologia Molecular de Barcelona, primeres autores del treball, destaquen com "combinant criomicroscopía electrònica i cristal·lografia de raigs X de sincrotró ens ha permès no només resoldre l'estructura atòmica d'un complex de grans dimensions, fet que suposa un desafiament tècnic, sinó també definir un model d'obertura i tancament del portal durant el procés de maduració de la càpsida viral". D'aquesta manera, els científics han pogut identificar quines són les interaccions entre les diferents proteïnes que permeten els canvis en la conformació del complex, des d'una estructura oberta per permetre el pas de l'ADN viral a una tancada en formar les partícules virals madures.
Aquest treball ha comptat amb el finançament del programa d'excel·lència "Sever Ochoa" i "María de Maeztu", el programa "Ramón i Cajal" del Ministeri de Ciència, Innovació i Universitats, i els projectes europeus iNEXT i Instruct-ERIC.
Referència: Ana Cuervo, Montserrat Fàbrega-Ferrer, Cristina Machón, José Javier Conesa, Francisco J. Javier Fernández, Rosa Pérez-Luque, Mar Pérez-Ruiz, Joan Pous, María Cristina Vega, José L. Carrascosa y Miquel Coll. Structures of T7 bacteriophage portal and tail suggest a viral DNA retention and ejection mechanism. Nature Communications. DOI: 10.1038/s41467-019-11705-9
Noticia vía Susana de Lucas (CSIC)